El Comité Permanente estará integrado por los miembros de la Junta Directiva, 17 representantes de las Comunidades Autónomas, 9 representantes de las Facultades de Veterinaria, 1 representante de los Centros de Investigación y 2 representantes de las Empresas Privadas relacionadas con el campo de la Reproducción Animal.
Se reunirá al menos una vez al año en sesión ordinaria, y en sesión extraordinaria cuantas veces sea solicitado por al menos el 20 % de sus miembros.